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우주 평화를 되찾기 위해 싸우는 갤럭시포스 앞에 다크매터의 독립부대인 게스인더베이와 그 부하들이 나타난다.
게스인더베이는 쇼론포에게 복수하고, 명왕 하데스의 파수견, 우주의 파괴신으로 불리는 켈베로스 보이저를 손에 넣은 뒤 게스스타를 이용해 지구를 파괴시키려 하고 있었다.
갤럭시포스는 지구가 파괴되는 걸 막기 위해 켈베로스 스톤을 찾아 나서는데…